Cronobacter sakazakii: Cronobacter sakazakii , som før 2007 ble kalt Enterobacter sakazakii , er en opportunistisk gramnegativ, stavformet, patogen bakterie som kan leve veldig tørre steder. Flertallet av Cronobacter sakazakii- tilfeller er voksne, men premature nyfødte og eldre spedbarn med lav fødselsvekt har størst risiko. Sykdommen er forbundet med en sjelden årsak til invasiv infeksjon hos spedbarn med historisk høye dødsfall (40–80%).
Liste over Enix hjemme-dataspill: Enix var et japansk selskap for videospill som ble grunnlagt i september 1975 av Yasuhiro Fukushima. Opprinnelig et tabloidforlegger ved navn Eidansha Boshu Service Center, våget det i 1982 å publisere videospill for japanske hjemmemaskiner som PC-8800-serien, X1-serien og FM-7. Fukushima hadde ingen programmeringskunnskaper og ansatte ikke interne programmerere eller spilldesignere. I stedet holdt han en konkurranse for programmering av hobbyister for å samle talenter og publisere utvalgte spill, med en pris på 1 million ¥ for topprisen (US $ 5000). Få bidrag ble mottatt den første måneden, men etter en markedsføringskampanje på TV og i husholdningsbutikker, hobbyklubber og datamaskin- og mangamagasiner, mottok tre hundre bidrag på slutten av "First Game Hobby Program Contest".
Bakterielle cellulære morfologier: Bakterier og Archaea klassifiseres ved direkte undersøkelse med lysmikroskopet i henhold til deres morfologi og arrangement.
Phobaeticus serratipes: Phobaeticus serratipes er en art stikkinsekt som på et tidspunkt var det lengste kjente insektet, med ett kvinnelig eksemplar registrert som 555 mm langt. Denne målingen inkluderer bena helt forlenget foran og bak, og den faktiske lengden på kroppen alene er betydelig kortere. Dette insektet er endemisk i Malaysia, Singapore og Sumatra. Det er en populær art blant de som oppdretter stokkinsekter.
Menneskelig mikrobiom: Det humane mikrobiomet er aggregatet av all mikrobiota som ligger på eller i humant vev og biofluider sammen med de tilsvarende anatomiske stedene de oppholder seg i, inkludert hud, brystkjertler, sædvæske, livmor, eggstokkfollikler, lunge, spytt, munnslimhinne , bindehinne, galleveier og mage-tarmkanalen. Typer av menneskelig mikrobiota inkluderer bakterier, archaea, sopp, protister og virus. Selv om mikrodyr også kan leve på menneskekroppen, er de vanligvis ekskludert fra denne definisjonen. I sammenheng med genomikk, er begrepet humant mikrobiom noen ganger brukt om de kollektive genomene til hjemmehørende mikroorganismer; imidlertid har begrepet menneskelig metagenom samme betydning.
Sandfilter: Sandfiltre brukes som et trinn i vannbehandlingsprosessen med vannrensing.
Bakteriekapsel: Bakteriekapslen er en stor struktur som er felles for mange bakterier. Det er et polysakkaridlag som ligger utenfor cellehylsteret, og anses derfor som en del av den ytre hylsteret til en bakteriecelle. Det er et godt organisert lag, ikke lett vasket av, og det kan være årsaken til forskjellige sykdommer.
Bakterie: Bakterier er en type biologisk celle. De utgjør et stort domene av prokaryote mikroorganismer. Vanligvis noen få mikrometer i lengde, bakterier har en rekke former, alt fra kuler til stenger og spiraler. Bakterier var blant de første livsformene som dukket opp på jorden, og er til stede i de fleste av dens habitater. Bakterier lever i jord, vann, sure varme kilder, radioaktivt avfall og den dype biosfæren til jordskorpen. Bakterier lever også i symbiotiske og parasittiske forhold til planter og dyr. De fleste bakterier har ikke blitt karakterisert, og bare om lag 27 prosent av bakteriefylene har arter som kan dyrkes i laboratoriet. Studien av bakterier er kjent som bakteriologi, en gren av mikrobiologi.
Bakterier kollektiv bevegelse: Bakterier kollektiv bevegelse refererer til den kollektive oppførselen til bakterier observert i bakterieverdenen.
Bakteriell konjugasjon: Bakteriell konjugasjon er overføring av genetisk materiale mellom bakterieceller ved direkte celle-til-celle-kontakt eller ved en brolignende forbindelse mellom to celler. Dette skjer gjennom en pilus. Det er en parasexual reproduksjonsmåte hos bakterier.
Vekstmedium: Et vekstmedium eller dyrkningsmedium er et fast, flytende eller halvfast stoff designet for å støtte veksten av en populasjon av mikroorganismer eller celler via prosessen med celleproliferasjon eller små planter som mosen Physcomitrella patens . Ulike typer medier brukes til å dyrke forskjellige typer celler.
Liste over bakterier: Denne artikkelen lister opp bakteriene.
Mikrobiell kunst: Mikrobiell kunst , agarkunst eller kimkunst er kunstverk laget av dyrking av mikroorganismer i visse mønstre. Mikrobene som brukes kan være bakterier, gjærsopp, eller sjeldnere protister. Mikrobene kan velges for deres naturlige farger, eller kan konstrueres for å uttrykke fluorescerende proteiner og settes under ultrafiolett lys for å få dem til å fluorescere i fargen.
Menneskelige interaksjoner med mikrober: Menneskelige interaksjoner med mikrober inkluderer både praktiske og symbolske bruksområder av mikrober, og negative interaksjoner i form av mennesker, husdyr og avlingssykdommer.
Menneskelig mikrobiom: Det humane mikrobiomet er aggregatet av all mikrobiota som ligger på eller i humant vev og biofluider sammen med de tilsvarende anatomiske stedene de oppholder seg i, inkludert hud, brystkjertler, sædvæske, livmor, eggstokkfollikler, lunge, spytt, munnslimhinne , bindehinne, galleveier og mage-tarmkanalen. Typer av menneskelig mikrobiota inkluderer bakterier, archaea, sopp, protister og virus. Selv om mikrodyr også kan leve på menneskekroppen, er de vanligvis ekskludert fra denne definisjonen. I sammenheng med genomikk, er begrepet humant mikrobiom noen ganger brukt om de kollektive genomene til hjemmehørende mikroorganismer; imidlertid har begrepet menneskelig metagenom samme betydning.
Menneskelige interaksjoner med mikrober: Menneskelige interaksjoner med mikrober inkluderer både praktiske og symbolske bruksområder av mikrober, og negative interaksjoner i form av mennesker, husdyr og avlingssykdommer.
Menneskelig mikrobiom: Det humane mikrobiomet er aggregatet av all mikrobiota som ligger på eller i humant vev og biofluider sammen med de tilsvarende anatomiske stedene de oppholder seg i, inkludert hud, brystkjertler, sædvæske, livmor, eggstokkfollikler, lunge, spytt, munnslimhinne , bindehinne, galleveier og mage-tarmkanalen. Typer av menneskelig mikrobiota inkluderer bakterier, archaea, sopp, protister og virus. Selv om mikrodyr også kan leve på menneskekroppen, er de vanligvis ekskludert fra denne definisjonen. I sammenheng med genomikk, er begrepet humant mikrobiom noen ganger brukt om de kollektive genomene til hjemmehørende mikroorganismer; imidlertid har begrepet menneskelig metagenom samme betydning.
Bakterie: Bakterier er en type biologisk celle. De utgjør et stort domene av prokaryote mikroorganismer. Vanligvis noen få mikrometer i lengde, bakterier har en rekke former, alt fra kuler til stenger og spiraler. Bakterier var blant de første livsformene som dukket opp på jorden, og er til stede i de fleste av dens habitater. Bakterier lever i jord, vann, sure varme kilder, radioaktivt avfall og den dype biosfæren til jordskorpen. Bakterier lever også i symbiotiske og parasittiske forhold til planter og dyr. De fleste bakterier har ikke blitt karakterisert, og bare om lag 27 prosent av bakteriefylene har arter som kan dyrkes i laboratoriet. Studien av bakterier er kjent som bakteriologi, en gren av mikrobiologi.
Menneskelig mikrobiom: Det humane mikrobiomet er aggregatet av all mikrobiota som ligger på eller i humant vev og biofluider sammen med de tilsvarende anatomiske stedene de oppholder seg i, inkludert hud, brystkjertler, sædvæske, livmor, eggstokkfollikler, lunge, spytt, munnslimhinne , bindehinne, galleveier og mage-tarmkanalen. Typer av menneskelig mikrobiota inkluderer bakterier, archaea, sopp, protister og virus. Selv om mikrodyr også kan leve på menneskekroppen, er de vanligvis ekskludert fra denne definisjonen. I sammenheng med genomikk, er begrepet humant mikrobiom noen ganger brukt om de kollektive genomene til hjemmehørende mikroorganismer; imidlertid har begrepet menneskelig metagenom samme betydning.
Bakteriofag: En bakteriofag , også kjent som en fag , er et virus som smitter og replikerer i bakterier og arkeaer. Begrepet stammer fra "bakterier" og gresk φαγεῖν, som betyr "å sluke". Bakteriofager består av proteiner som innkapsler et DNA- eller RNA-genom, og kan ha strukturer som er enkle eller forseggjorte. Deres genomer kan kode så få som fire gener og så mange som hundrevis av gener. Fager replikerer i bakterien etter injeksjonen av genomet i cytoplasmaet.
Bakteriell konjugasjon: Bakteriell konjugasjon er overføring av genetisk materiale mellom bakterieceller ved direkte celle-til-celle-kontakt eller ved en brolignende forbindelse mellom to celler. Dette skjer gjennom en pilus. Det er en parasexual reproduksjonsmåte hos bakterier.
Endospore: En endospore er en sovende, tøff og ikke-reproduktiv struktur produsert av noen bakterier i phylum Firmicutes. Navnet "endospore" tyder på en spore eller frølignende form, men det er ikke en ekte spore. Det er en strippet, sovende form som bakterien kan redusere seg selv til. Endosporedannelse utløses vanligvis av mangel på næringsstoffer, og forekommer vanligvis i gram-positive bakterier. Ved endospordannelse deler bakterien seg innenfor celleveggen, og den ene siden omslutter den andre. Endosporer gjør det mulig for bakterier å ligge i dvale i lengre perioder, til og med århundrer. Det er mange rapporter om at sporene er levedyktige i 10 000 år, og det er blitt hevdet gjenopplivelse av millioner av år gamle sporer. Det er en rapport om levedyktige sporer av Bacillus marismortui i saltkrystaller som er omtrent 250 millioner år gamle. Når miljøet blir gunstigere, kan endosporen reaktivere seg selv til den vegetative tilstanden. De fleste typer bakterier kan ikke endres til endosporeformen. Eksempler på bakteriearter som kan danne endosporer inkluderer Bacillus cereus , Bacillus anthracis , Bacillus thuringiensis , Clostridium botulinum og Clostridium tetani .
Stamme (biologi): I biologi er en stamme en genetisk variant, en undertype eller en kultur innen en biologisk art. Stammer blir ofte sett på som iboende kunstige konsepter, preget av en spesifikk intensjon for genetisk isolasjon. Dette observeres lettest i mikrobiologi der stammer er avledet fra en enkeltcellekoloni og blir typisk satt i karantene av de fysiske begrensningene til en petriskål. Stammer er også ofte referert til innen virologi, botanikk og med gnagere brukt i eksperimentelle studier.
Sverm oppførsel: Svermadferd , eller svermer , er en kollektiv atferd utstilt av enheter, spesielt dyr, av samme størrelse som samler seg, kanskje freser på samme sted eller kanskje beveger seg masse eller vandrer i en eller annen retning. Det er et veldig tverrfaglig tema. Som et begrep brukes sverming spesielt på insekter, men kan også brukes på alle andre enheter eller dyr som utviser svermeatferd. Begrepet flocking eller murmuration kan referere spesifikt til svermadferd hos fugler, herding for å referere til svermatferd hos tetrapoder, og shoaling eller skolegang for å referere til svermadferd hos fisk. Fytoplankton samles også i store svermer som kalles blomster , selv om disse organismer er alger og ikke er selvgående slik dyr er. I forlengelse blir begrepet "sverm" også brukt på livløse enheter som utviser parallell oppførsel, som i en robotsverm, en jordskjelvsverm eller en sverm av stjerner.
Liste over sekvenserte bakterielle genomer: Denne listen over sekvenserte eubakterielle genomer inneholder de fleste eubakteriene som er kjent for å ha offentlig tilgjengelige komplette genom-sekvenser. De fleste av disse sekvensene er plassert i International Nucleotide Sequence Database Collaboration, en offentlig database som det kan søkes på på nettet. Noen få av de oppførte genomene er kanskje ikke i INSDC-databasen, men i andre offentlige databaser.
Bakterie: Bakterier er en type biologisk celle. De utgjør et stort domene av prokaryote mikroorganismer. Vanligvis noen få mikrometer i lengde, bakterier har en rekke former, alt fra kuler til stenger og spiraler. Bakterier var blant de første livsformene som dukket opp på jorden, og er til stede i de fleste av dens habitater. Bakterier lever i jord, vann, sure varme kilder, radioaktivt avfall og den dype biosfæren til jordskorpen. Bakterier lever også i symbiotiske og parasittiske forhold til planter og dyr. De fleste bakterier har ikke blitt karakterisert, og bare om lag 27 prosent av bakteriefylene har arter som kan dyrkes i laboratoriet. Studien av bakterier er kjent som bakteriologi, en gren av mikrobiologi.
Bakterie: Bakterier er en type biologisk celle. De utgjør et stort domene av prokaryote mikroorganismer. Vanligvis noen få mikrometer i lengde, bakterier har en rekke former, alt fra kuler til stenger og spiraler. Bakterier var blant de første livsformene som dukket opp på jorden, og er til stede i de fleste av dens habitater. Bakterier lever i jord, vann, sure varme kilder, radioaktivt avfall og den dype biosfæren til jordskorpen. Bakterier lever også i symbiotiske og parasittiske forhold til planter og dyr. De fleste bakterier har ikke blitt karakterisert, og bare om lag 27 prosent av bakteriefylene har arter som kan dyrkes i laboratoriet. Studien av bakterier er kjent som bakteriologi, en gren av mikrobiologi.
Bakteriell, arkaeal og planteplastkode: Bakterie-, arke- og plante-plastid-koden er DNA-koden som brukes av bakterier, archaea, prokaryote virus og kloroplastproteiner. Det er egentlig det samme som standardkoden, men det er noen variasjoner i alternative startkodoner.
Bakterielt kunstig kromosom: Et bakterielt kunstig kromosom ( BAC ) er en DNA-konstruksjon, basert på et funksjonelt fruktbarhetsplasmid, brukt til transformasjon og kloning i bakterier, vanligvis E. coli . F-plasmider spiller en avgjørende rolle fordi de inneholder partisjonsgener som fremmer jevn fordeling av plasmider etter bakteriecelledeling. Det bakterielle kunstige kromosomets vanlige innsatsstørrelse er 150–350 kbp. En lignende kloningsvektor kalt PAC er også produsert fra DNA fra P1-bakteriofag.
Bakteriell svamp av kassava: Xanthomonas axonopodis pv. manihotis er patogenet som forårsaker bakteriell rødme av kassava . Opprinnelig oppdaget i Brasil i 1912, har sykdommen fulgt dyrking av kassava over hele verden. Blant sykdommer som rammer kassava over hele verden, forårsaker bakteriell røde de største tapene når det gjelder avling.
Bakteriell svamp av soyabønner: Bakteriell svamp av soyabønner er en utbredt sykdom forårsaket av Pseudomonas syringae pv. glycinea.
Clavibacter michiganensis: Clavibacter michiganensis er en aerob ikke-sporulerende Gram-positiv plantepatogen actinomycete som for tiden utgjør den eneste arten innen slekten Clavibacter . De andre tidligere Clavibacter- artene er omklassifisert til slektene Leifsonia , Rathayibacter og Curtobacterium . Clavibacter michiganensis har ni underarter; alle er tilgjengelige fra Fera Science for legitime forskere. Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis og Clavibacter michiganensis subsp. sepedonicus er de viktigste sykdommene som forårsaker betydelige økonomiske tap over hele verden ved å skade tomater og poteter.
Bakteriell cellulose: Bakteriell cellulose er en organisk forbindelse med formelen (C 6 H 10 O 5 ) n produsert av visse typer bakterier. Mens cellulose er et grunnleggende strukturmateriale for de fleste planter, produseres det også av bakterier, hovedsakelig av slektene Acetobacter , Sarcina ventriculi og Agrobacterium . Bakteriell, eller mikrobiell, cellulose har forskjellige egenskaper enn plantecellulose og er preget av høy renhet, styrke, formbarhet og økt evne til å holde vann. I naturlige habitater syntetiserer flertallet av bakterier ekstracellulære polysakkarider, som cellulose, som danner beskyttende konvolutter rundt cellene. Mens bakteriell cellulose produseres i naturen, blir mange metoder for tiden undersøkt for å forbedre cellulosevekst fra kulturer i laboratorier som en storskala prosess. Ved å kontrollere syntesemetoder kan den resulterende mikrobielle cellulosen skreddersys for å ha spesifikke ønskelige egenskaper. For eksempel har bakteriene Acetobacter xylinum blitt lagt merke til på grunn av cellulosens unike mekaniske egenskaper og anvendelser innen bioteknologi, mikrobiologi og materialvitenskap. Historisk har bakteriecellulose vært begrenset til fremstilling av Nata de coco, et sørøstasiatisk matprodukt. Med fremskritt i evnen til å syntetisere og karakterisere bakteriell cellulose, blir materialet brukt til et bredt spekter av kommersielle bruksområder, inkludert tekstiler, kosmetikk og matvarer, så vel som medisinske anvendelser. Mange patenter er utstedt i mikrobiell celluloseapplikasjon, og flere aktive forskningsområder forsøker å bedre karakterisere mikrobiell cellulose og bruke den i nye områder.
Bakteriell døgnrytme: Bakterielle døgnrytmer , som andre døgnrytmer, er endogene "biologiske klokker" som har følgende tre egenskaper: (a) under konstante forhold svinger de med en periode som er nær, men ikke nøyaktig, 24 timer i varighet, (b) denne "frittløpende" rytmen er temperaturkompensert, og (c) rytmen vil medføre en passende miljøsyklus.
Bakteriell kaldtvannsykdom: Bakteriell kaldtvannsykdom (BCWD) er en bakteriell sykdom hos ferskvannsfisk, spesielt laksefisk. Det er forårsaket av bakterien Flavobacterium psychrophilum , en psykrofil, gram-negativ stavformet bakterie av familien Flavobacteriaceae. Denne bakterien finnes i ferskvann med den optimale veksttemperaturen under 13⁰C, og den kan sees i ethvert område med vanntemperaturer konstant under 15⁰C. Laks er den mest berørte arten. Denne sykdommen er ikke zoonotisk.
Optimalisering av bakteriekoloni: Optimaliseringsalgoritmen for bakteriekolonien er en optimaliseringsalgoritme som er basert på en livssyklusmodell som simulerer noen typiske atferd av E. coli-bakterier i løpet av hele deres livssyklus, inkludert cellegift, kommunikasjon, eliminering, reproduksjon og migrasjon.
Sirkulært kromosom: Et sirkulært kromosom er et kromosom i bakterier, archaea, mitokondrier og kloroplaster, i form av et molekyl av sirkulært DNA, i motsetning til det lineære kromosomet til de fleste eukaryoter.
Bakterielt DNA-bindende protein: I molekylærbiologi er bakterielle DNA-bindende proteiner en familie av små, vanligvis basiske proteiner med omtrent 90 rester som binder DNA og er kjent som histonlignende proteiner. Siden bakteriebindende proteiner har et mangfold av funksjoner, har det vært vanskelig å utvikle en felles funksjon for dem alle. De blir ofte referert til som histonlignende og har mange lignende egenskaper med de eukaryote histonproteinene. Eukaryote histoner pakker DNA for å hjelpe det til å passe inn i kjernen, og de er kjent for å være de mest konserverte proteinene i naturen. Eksempler inkluderer HU-proteinet i Escherichia coli , en dimer av nært beslektede alfa- og beta-kjeder, og i andre bakterier kan det være en dimer av identiske kjeder. HU-type proteiner har blitt funnet i en rekke bakterier og archaea, og er også kodet i kloroplastgenomet til noen alger. Integrasjonsvertsfaktoren (IHF), en dimer av nært beslektede kjeder som antydes å fungere i genetisk rekombinasjon så vel som i translationell og transkripsjonskontroll, finnes i Enterobakterier og virale proteiner inkludert det afrikanske svinepestvirusproteinet A104R.
Bakterielt DNA-bindende protein: I molekylærbiologi er bakterielle DNA-bindende proteiner en familie av små, vanligvis basiske proteiner med omtrent 90 rester som binder DNA og er kjent som histonlignende proteiner. Siden bakteriebindende proteiner har et mangfold av funksjoner, har det vært vanskelig å utvikle en felles funksjon for dem alle. De blir ofte referert til som histonlignende og har mange lignende egenskaper med de eukaryote histonproteinene. Eukaryote histoner pakker DNA for å hjelpe det til å passe inn i kjernen, og de er kjent for å være de mest konserverte proteinene i naturen. Eksempler inkluderer HU-proteinet i Escherichia coli , en dimer av nært beslektede alfa- og beta-kjeder, og i andre bakterier kan det være en dimer av identiske kjeder. HU-type proteiner har blitt funnet i en rekke bakterier og archaea, og er også kodet i kloroplastgenomet til noen alger. Integrasjonsvertsfaktoren (IHF), en dimer av nært beslektede kjeder som antydes å fungere i genetisk rekombinasjon så vel som i translationell og transkripsjonskontroll, finnes i Enterobakterier og virale proteiner inkludert det afrikanske svinepestvirusproteinet A104R.
BacDive: Bac Dive er en bakteriell metadatabase som gir stammelinket informasjon om bakteriell og arkeologisk biologisk mangfold.
Bakterielt effektorprotein: Bakterielle effektorer er proteiner som skilles ut av patogene bakterier i cellene til verten, vanligvis ved hjelp av et type 3-sekresjonssystem (TTSS / T3SS), et type 4-sekresjonssystem (TFSS / T4SS) eller et Type VI-sekresjonssystem (T6SS). Noen bakterier injiserer bare noen få effektorer i vertscellene, mens andre kan injisere dusinvis eller hundrevis. Effektorproteiner kan ha mange forskjellige aktiviteter, men hjelper vanligvis patogenet med å invadere vertsvevet, undertrykke immunforsvaret eller på annen måte hjelpe patogenet til å overleve. Effektorproteiner er vanligvis kritiske for virulens. For eksempel, i det forårsakende middel for pest, er tapet av T3SS tilstrekkelig til å gjøre bakteriene fullstendig avirulente, selv når de blir direkte introdusert i blodet. Gramnegative mikrober mistenkes også å distribuere bakterielle ytre membranvesikler for å translokere effektorproteiner og virulensfaktorer via en sekretærvei for handel med membranvesikler for å modifisere miljøet eller angripe / invadere målceller, for eksempel ved vertspatogengrensesnittet.
Bakteriell filtreringseffektivitet: Bakteriell filtreringseffektivitet eller BFE er en måling av motstandsdyktigheten til åndedrettsmaterialet mot penetrasjon av bakterier. Resultatene rapporteres som prosent effektivitet og korrelerer med stoffets evne til å motstå bakteriell penetrasjon. Høyere tall i denne testen indikerer bedre barriereeffektivitet. Pakkestoffer ble sammenlignet basert på klasse så vel som basisvekt.
Genomenklatur: Genomenklatur er den vitenskapelige navngivningen av gener, arveenhetene i levende organismer. Det er også nært forbundet med proteinnomenklatur, da gener og proteiner de koder for, vanligvis har lignende nomenklatur. En internasjonal komité publiserte anbefalinger for genetiske symboler og nomenklatur i 1957. Behovet for å utvikle formelle retningslinjer for menneskelige gennavn og symboler ble anerkjent på 1960-tallet, og fullstendige retningslinjer ble gitt i 1979. Flere andre slektspesifikke forskningsmiljøer har vedtatt nomenklaturstandarder, også, og har publisert dem på de aktuelle modellorganismens nettsteder og i vitenskapelige tidsskrifter, inkludert Trends in Genetics Genetic Nomenclature Guide. Forskere som er kjent med en bestemt genfamilie, kan samarbeide om å revidere nomenklaturen for hele gener av gen når ny informasjon blir tilgjengelig. For mange gener og deres tilhørende proteiner er et utvalg av alternative navn i bruk på tvers av vitenskapelig litteratur og offentlige biologiske databaser, noe som utgjør en utfordring for effektiv organisering og utveksling av biologisk informasjon. Standardisering av nomenklatur prøver således å oppnå fordelene med ordforrådskontroll og bibliografisk kontroll, selv om overholdelse er frivillig. Fremveksten av informasjonsalderen har brakt genontologi, som på noen måter er et neste trinn i genomenklaturen, fordi det tar sikte på å forene representasjonen av gen- og genproduktattributter for alle arter.
Bakteriell genom: Bakterielle genomer er generelt mindre og mindre varierende i størrelse blant arter sammenlignet med genomer av eukaryoter. Bakterielle genomer kan variere i størrelse alt fra omtrent 130 kbp til over 14 Mbp. En studie som inkluderte, men ikke var begrenset til, 478 bakteriegenomer, konkluderte med at når genomstørrelsen øker, øker antall gener med en uforholdsmessig lavere hastighet i eukaryoter enn hos ikke-eukaryoter. Dermed øker andelen ikke-kodende DNA raskere med genomstørrelse hos ikke-bakterier enn i bakterier. Dette stemmer overens med det faktum at de fleste eukaryote nukleære DNA er ikke-genkodende, mens de fleste prokaryote, virale og organellare gener koder. Akkurat nå har vi genomssekvenser fra 50 forskjellige bakteriefyler og 11 forskjellige arkefyler. Andre generasjons sekvensering har gitt mange utkast genomer; tredje generasjons sekvensering kan til slutt gi et komplett genom på få timer. Genomsekvensene avslører mye mangfold i bakterier. Analyse av over 2000 Escherichia coli- genomer avslører et E. coli- kjernegenom på ca 3100 genfamilier og totalt ca 89 000 forskjellige genfamilier. Genomsekvenser viser at parasittbakterier har 500–1200 gener, frilevende bakterier har 1500–7500 gener, og archaea har 1500–2700 gener. Et slående funn av Cole et al. beskrev enorme mengder genforfall når man sammenligner spedalskhetsbasille med forfedres bakterier. Studier har siden vist at flere bakterier har mindre genomstørrelser enn deres forfedre hadde. Gjennom årene har forskere foreslått flere teorier for å forklare den generelle trenden med forfall av bakteriell genom og den relativt lille størrelsen på bakterielle genomer. Tvingende bevis indikerer at den tilsynelatende nedbrytningen av bakterielle genomer skyldes en slettingsforstyrrelse.
Bakterie: Bakterier er en type biologisk celle. De utgjør et stort domene av prokaryote mikroorganismer. Vanligvis noen få mikrometer i lengde, bakterier har en rekke former, alt fra kuler til stenger og spiraler. Bakterier var blant de første livsformene som dukket opp på jorden, og er til stede i de fleste av dens habitater. Bakterier lever i jord, vann, sure varme kilder, radioaktivt avfall og den dype biosfæren til jordskorpen. Bakterier lever også i symbiotiske og parasittiske forhold til planter og dyr. De fleste bakterier har ikke blitt karakterisert, og bare om lag 27 prosent av bakteriefylene har arter som kan dyrkes i laboratoriet. Studien av bakterier er kjent som bakteriologi, en gren av mikrobiologi.
Infeksjon: En infeksjon er invasjonen av organismens kroppsvev av sykdomsfremkallende midler, deres multiplikasjon og reaksjonen av vertsvev til de smittsomme stoffene og giftstoffene de produserer. En smittsom sykdom , også kjent som en overførbar sykdom eller smittsom sykdom , er en sykdom som skyldes infeksjon.
Bakteriell bladstrek: Bakteriell bladstripe (BLS), også kjent som svart kaf , er en vanlig bakteriell sykdom i hvete. Sykdommen er forårsaket av bakteriearten Xanthomonas translucens pv. undulosa . Patogenet finnes globalt, men er et primært problem i USA i nedre midt-sør og kan redusere avlingene med opptil 40 prosent. [6] BLS er først og fremst frøbåret og overlever i og på frøet, men kan også overleve i avlingsrester i jorden i lavsesongen. I vekstsesongen kan bakteriene overføres fra plante til plante ved kontakt, men den spres først og fremst ved kontakt med regn, vind og insekter. Bakteriene trives i fuktige omgivelser, og produserer en krem ​​til gul bakteriell ose, som når den er tørr, virker lys og fargelignende, og resulterer i en stripe på bladene. Invasjonen av hodet på hvete forårsaker bånd av nekrotisk vev på markisene, som kalles Black Chaff. [14] Sykdommen håndteres ikke lett, da det ikke er noen plantevernmidler på markedet for behandling av infeksjonen. Det er noen resistente sorter tilgjengelig, men det finnes ingen behandling med frø. Noen integrerte skadedyrsbekjempelsesmetoder (IPM) kan brukes til å forhindre smitte, men ingen vil forhindre sykdommen helt. [2]
Bakteriell leucintransportør: Bakteriell leucintransportør ( LeuT ) er et buntet tolv alfa-helixprotein som tilhører familien av transportører som skyter aminosyrer inn og ut av bakterieceller. Spesialisert i små hydrofobe aminosyrer som leucin og alanin, drives denne transportøren av gradienten av natriumioner som normalt opprettholdes av sunne celler over membranene. LeuT fungerer som en symporter, noe som betyr at den kobler passasjen til et natriumion over cellemembranen med transporten av aminosyren i samme retning. Det ble først krystallisert for å forstå de indre molekylære mekanismene i antidepressiva, siden det har en stor likhet med de menneskelige nevrotransmittertransportørene som disse stoffene blokkerer, og dermed hemmer gjenopptaket av kjemiske budbringere over cellemembranen til nerveaksoner og gliaceller.
Meningitt: Meningitt er en akutt betennelse i de beskyttende membranene som dekker hjernen og ryggmargen, kjent samlet som hjernehinnene. De vanligste symptomene er feber, hodepine og stivhet i nakken. Andre symptomer inkluderer forvirring eller endret bevissthet, oppkast og manglende evne til å tåle lett eller høye lyder. Små barn viser ofte bare uspesifikke symptomer, som irritabilitet, døsighet eller dårlig fôring. Hvis det er utslett, kan det indikere en bestemt årsak til hjernehinnebetennelse; for eksempel kan meningitt forårsaket av meningokokkbakterier være ledsaget av et karakteristisk utslett.
Bakteriell murein forløper eksportør: Den bakterielle mureinforløpereksportørfamilien (MPE) er et medlem av superfamilien til kationediffusjonsfasilitator (CDF) til membrantransportører. Medlemmer av MPE-familien finnes i et stort utvalg av gramnegative og grampositive bakterier og letter translokasjon av lipidbundne mureinforløpere. En representativ liste over proteiner som tilhører MPE-familien finner du i Transporter Classification Database .
Bakterielle nanotråder: Bakterielle nanotråder er elektrisk ledende vedheng produsert av en rekke bakterier, spesielt fra slektene Geobacter og Shewanella . Ledende nanotråder er også bekreftet i den oksygeniske cyanobacterium Synechocystis PCC6803 og en termofil, metanogen coculture bestående av Pelotomaculum thermopropionicum og Methanothermobacter thermoautotrophicus . Fra fysiologiske og funksjonelle perspektiver er bakterielle nanotråder forskjellige. Den nøyaktige rollen mikrobielle nanotråder spiller i deres biologiske systemer er ikke fullstendig realisert, men det finnes flere foreslåtte funksjoner. Utenfor et naturlig forekommende miljø har bakterielle nanotråder vist potensial for å være nyttige innen flere felt, særlig innen bioenergi og biomedisinering.
Bakterielle ytre membranvesikler: Bakterielle ytre membranvesikler ( OMV ) er vesikler av lipider frigjort fra ytre membraner av gramnegative bakterier. Disse vesiklene var de første bakterielle membranvesiklene (MV) som ble oppdaget, mens grampositive bakterier også frigjør vesikler. Ytre membranvesikler ble først oppdaget og karakterisert ved hjelp av overføringselektronmikroskopi av den indiske forskeren professor Smriti Narayan Chatterjee og J. Das i 1966-67. OMV-er tilskrives funksjonaliteten for å gi en måte å kommunisere seg imellom, med andre mikroorganismer i sitt miljø og med verten. Disse vesiklene er involvert i handel med bakteriecellesignalering av biokjemikalier, som kan omfatte DNA, RNA, proteiner, endotoksiner og allierte virulensmolekyler. Denne kommunikasjonen skjer i mikrobielle kulturer i havene, i dyr, planter og til og med i menneskekroppen.
Bakteriell fylodynamikk: Bakteriell fylodynamikk er studiet av immunologi, epidemiologi og fylogenetikk av bakterielle patogener for bedre å forstå disse patogenens evolusjonære rolle. Fylodynamisk analyse inkluderer analyse av genetisk mangfold, naturlig utvalg og populasjonsdynamikk av smittsomme sykdomspatogenfylogenier under pandemier og studering av virusutvikling innen verten. Fylodynamikk kombinerer studiet av fylogenetisk analyse, økologiske og evolusjonære prosesser for bedre å forstå mekanismene som driver spatiotemportal forekomst og fylogenetiske mønstre av bakterielle patogener. Bakteriell fylodynamikk bruker genomdekkende enkeltnukleotidpolymorfier (SNP) for å bedre forstå den evolusjonære mekanismen til bakterielle patogener. Mange fylodynamiske studier er utført på virus, spesielt RNA-virus som har høye mutasjonshastigheter. Feltet med bakteriell fylodynamikk har økt betydelig på grunn av utviklingen av neste generasjons sekvensering og mengden data tilgjengelig.
Plantepatologi: Plantepatologi er den vitenskapelige studien av sykdommer i planter forårsaket av patogener og miljøforhold. Organismer som forårsaker smittsom sykdom inkluderer sopp, oomycetes, bakterier, virus, viroider, viruslignende organismer, fytoplasmaer, protozoer, nematoder og parasittplanter. Ikke inkludert er ektoparasitter som insekter, midd, virveldyr eller andre skadedyr som påvirker plantehelsen ved å spise av plantevev. Plantepatologi innebærer også studier av patogenidentifikasjon, sykdomsetiologi, sykdomsykluser, økonomisk innvirkning, plantesykdomsepidemiologi, plantesykdomsresistens, hvordan plantesykdommer påvirker mennesker og dyr, patosystemgenetikk og behandling av plantesykdommer.
Ribonuklease P: Ribonuklease P er en type ribonuklease som spalter RNA. RNase P er unik fra andre RNaser ved at det er et ribozym - en ribonukleinsyre som fungerer som en katalysator på samme måte som et proteinbasert enzym ville gjort. Dens funksjon er å klyve av en ekstra, eller forløper, RNA-sekvens på tRNA-molekyler. Videre er RNase P en av to kjente ribozymer med flere omsetninger i naturen, og oppdagelsen som ga Sidney Altman og Thomas Cech Nobelprisen i kjemi i 1989: på 1970-tallet oppdaget Altman eksistensen av forløper-tRNA med flankerende sekvenser og var den først for å karakterisere RNase P og dens aktivitet i prosessering av 5'-ledersekvensen til forløper tRNA. Nyere funn avslører også at RNase P har en ny funksjon. Det har blitt vist at human kjernefysisk RNase P er nødvendig for normal og effektiv transkripsjon av forskjellige små ikke-kodende RNA, slik som tRNA, 5S rRNA, SRP RNA og U6 snRNA gener, som er transkribert av RNA polymerase III, en av tre store kjernefysiske RNA-polymeraser i humane celler.
Ribonuklease P: Ribonuklease P er en type ribonuklease som spalter RNA. RNase P er unik fra andre RNaser ved at det er et ribozym - en ribonukleinsyre som fungerer som en katalysator på samme måte som et proteinbasert enzym ville gjort. Dens funksjon er å klyve av en ekstra, eller forløper, RNA-sekvens på tRNA-molekyler. Videre er RNase P en av to kjente ribozymer med flere omsetninger i naturen, og oppdagelsen som ga Sidney Altman og Thomas Cech Nobelprisen i kjemi i 1989: på 1970-tallet oppdaget Altman eksistensen av forløper-tRNA med flankerende sekvenser og var den først for å karakterisere RNase P og dens aktivitet i prosessering av 5'-ledersekvensen til forløper tRNA. Nyere funn avslører også at RNase P har en ny funksjon. Det har blitt vist at human kjernefysisk RNase P er nødvendig for normal og effektiv transkripsjon av forskjellige små ikke-kodende RNA, slik som tRNA, 5S rRNA, SRP RNA og U6 snRNA gener, som er transkribert av RNA polymerase III, en av tre store kjernefysiske RNA-polymeraser i humane celler.
Partikkel-RNA for signalgjenkjenning: Signalgjenkjenningspartikkel-RNA er en del av signalgjenkjenningspartikkel (SRP) ribonukleoproteinkompleks. SRP gjenkjenner signalpeptidet og binder seg til ribosomet, og stopper proteinsyntese. SRP-reseptor er et protein som er innebygd i en membran, og som inneholder en transmembranpore. Når SRP-ribosomkomplekset binder seg til SRP-reseptor , frigjør SRP ribosomet og driver bort. Ribosomet gjenopptar proteinsyntese, men nå beveger proteinet seg gjennom SRP-reseptorens transmembrane pore.
Bakteriell myk råte: Bakterielle myke rotter er forårsaket av flere typer bakterier, men oftest av arter av gramnegative bakterier, Erwinia , Pectobacterium og Pseudomonas . Det er en destruktiv sykdom av frukt, grønnsaker og prydplanter som finnes over hele verden, og rammer slekter fra nesten alle plantefamiliene. Bakteriene angriper hovedsakelig de kjøttfulle lagringsorganene til vertene deres, men de påvirker også saftige knopper, stilker og petiolevev. Ved hjelp av spesielle enzymer blir planten omgjort til en flytende mos for at bakteriene skal konsumere plantecellens næringsstoffer. Sykdomsutbredelse kan være forårsaket av enkel fysisk interaksjon mellom infisert og sunt vev under lagring eller transitt. Sykdommen kan også spres av insekter. Kontroll av sykdommen er ikke alltid veldig effektiv, men hygienepraksis i produksjon, lagring og prosessering er noe som kan gjøres for å bremse spredningen av sykdommen og beskytte avlingene.
Bakteriell vaginose: Bakteriell vaginose ( BV ) er en sykdom i skjeden forårsaket av overdreven vekst av bakterier. Vanlige symptomer inkluderer økt utflod som ofte lukter fisk. Utslippet er vanligvis hvitt eller grått i fargen. Forbrenning med vannlating kan forekomme. Kløe er uvanlig. Noen ganger kan det ikke være noen symptomer. Å ha BV dobler tilnærmet risikoen for infeksjon av en rekke seksuelt overførbare infeksjoner, inkludert HIV / AIDS. Det øker også risikoen for tidlig fødsel blant gravide kvinner.
Ralstonia solanacearum: Ralstonia solanacearum er en aerob ikke-spordannende, gramnegativ, plantepatogen bakterie. R. solanacearum er jordbåren og bevegelig med en polær flagellertuft. Det koloniserer xylem, forårsaker bakteriell visshet i et veldig bredt spekter av potensielle vertsplanter. Det er kjent som Granville vilje når det forekommer i tobakk. Bakterielle wilts av tomat, pepper, aubergine og irsk potet forårsaket av R. solanacearum var blant de første sykdommene som Erwin Frink Smith viste seg å være forårsaket av et bakteriepatogen. På grunn av sin ødeleggende dødelighet er R. solanacearum nå en av de mer intensivt studerte fytopatogene bakteriene, og bakteriell visshet av tomat er et modellsystem for å undersøke mekanismer for patogenese. Ralstonia ble inntil nylig klassifisert som Pseudomonas , med likhet i de fleste aspekter, bortsett fra at det ikke produserer fluorescerende pigment som Pseudomonas . Genomene fra forskjellige stammer varierer fra 5,5 Mb opp til 6 Mb, omtrent 3,5 Mb av et kromosom og 2 Mb av et megaplasmid. Mens stammen GMI1000 var en av de første fytopatogene bakteriene som hadde fullført genomet, var stammen UY031 den første R. solanacearum som fikk sin metylom rapportert. Innenfor R. solanacearum- artskomplekset betegnes de fire store monofyletiske klyngene av stammer fylotyper, som er geografisk distinkte: fylotyper I-IV finnes i henholdsvis Asia, Amerika, Afrika og Oseania.
Paronychia: Paronychia er en betennelse i huden rundt neglen, som kan oppstå plutselig, når det vanligvis skyldes bakteriene Staph. aureus , eller gradvis når det ofte er forårsaket av Candida albicans . Begrepet er fra gresk: παρωνυχία fra para , "rundt", onyx , "spiker" og det abstrakte substantivet suffiks -ia .
Bakteriell adhesin: Adhesiner er celleoverflatekomponenter eller vedheng av bakterier som letter vedheft eller vedheft til andre celler eller til overflater, vanligvis i verten de smitter eller lever i. Adhesiner er en type virulensfaktor.
Bakteriell vedheft i vannsystemet: Bakteriell vedheft innebærer festing av bakterier på overflaten. Denne interaksjonen spiller en viktig rolle i naturlige systemer så vel som i miljøteknikk. Feste av biomasse på membranoverflaten vil resultere i tilsmussing av membranen, noe som kan redusere effektiviteten i rensesystemet betydelig ved bruk av membranfiltreringsprosess i avløpsrenseanlegg. Den lave vedheft av bakterier til jord er viktig for å lykkes med in-situ bioremediering i grunnvannsbehandling. Imidlertid kan forurensning av patogener i drikkevann være knyttet til transport av mikroorganismer i grunnvann og andre vannkilder. Kontroll og forebygging av den negative innvirkningen av bakteriell avsetning på vannmiljøet trenger en dyp forståelse om mekanismene i denne prosessen. DLVO teori har blitt brukt mye for å beskrive avsetning av bakterier i mange nåværende undersøkelser.
Bakteriell anaerob korrosjon: Bakteriell anaerob korrosjon er en bakteriell indusert oksidasjon av metaller.
Bakteriell antennekompleks: Bakterielle antenne-komplekse proteiner er de viktigste lysabsorberende komponentene i fotosyntetiske bakterier. Også kjent som et lyshøstingskompleks / system, er det bakterielle antennekomplekset ansvarlig for overføring av solenergi til det fotosyntetiske reaksjonssenteret.
Bakteriell archaeal holin familie: Putative Bacterial Archaeal Holin (BAH) -familien består av flere ikke-karakteriserte proteiner. Imidlertid ble disse proteinene hentet når funksjonelt karakteriserte holiner fra TA Hol-familien ble BLASTET mot NCBI-databasen, og kan dermed være relatert til TA Hol-familien. De fleste BAH-proteiner er mellom 125 og 140 aminoacylrester (aas) i lengde og viser 4 transmembrane segmenter (TMSer), selv om minst en antatt holin er nesten 260 aas lang. En representativ liste over proteiner som tilhører BAH-familien finnes i Transporter Classification Database .
Bakterielt kunstig kromosom: Et bakterielt kunstig kromosom ( BAC ) er en DNA-konstruksjon, basert på et funksjonelt fruktbarhetsplasmid, brukt til transformasjon og kloning i bakterier, vanligvis E. coli . F-plasmider spiller en avgjørende rolle fordi de inneholder partisjonsgener som fremmer jevn fordeling av plasmider etter bakteriecelledeling. Det bakterielle kunstige kromosomets vanlige innsatsstørrelse er 150–350 kbp. En lignende kloningsvektor kalt PAC er også produsert fra DNA fra P1-bakteriofag.
Bakterielt kunstig kromosom: Et bakterielt kunstig kromosom ( BAC ) er en DNA-konstruksjon, basert på et funksjonelt fruktbarhetsplasmid, brukt til transformasjon og kloning i bakterier, vanligvis E. coli . F-plasmider spiller en avgjørende rolle fordi de inneholder partisjonsgener som fremmer jevn fordeling av plasmider etter bakteriecelledeling. Det bakterielle kunstige kromosomets vanlige innsatsstørrelse er 150–350 kbp. En lignende kloningsvektor kalt PAC er også produsert fra DNA fra P1-bakteriofag.
Biobatteri: Et biobatteri er en energilagringsenhet som drives av organiske forbindelser, vanligvis glukose, slik som glukose i humant blod. Når enzymer i menneskekropper bryter ned glukose, frigjøres flere elektroner og protoner. Derfor, ved å bruke enzymer til å bryte ned glukose, mottar biobatterier direkte energi fra glukose. Da lagrer disse batteriene denne energien for senere bruk. Dette konseptet er nesten identisk med hvordan både planter og mange dyr bruker energi fra metabolske reaksjoner.
Bakteriell bindende proteinavhengig transportør: Bakterielt bindende proteinavhengige transportsystemer er multikomponentsystemer som vanligvis består av et periplasmatisk substratbindende protein, ett eller to gjensidige homologe integrerte indre membranproteiner og en eller to perifere membran ATP-bindende proteiner som kobler energi til det aktive transportsystemet. De integrerte indre membranproteinene translokerer substratet over membranen. Det er vist at de fleste av disse proteinene inneholder en konservert region som ligger omtrent 80 til 100 rester fra deres C-terminale ekstremitet. Denne regionen ser ut til å være lokalisert i en cytoplasmisk sløyfe mellom to transmembrane domener. Bortsett fra den konserverte regionen, er sekvensen til disse proteinene ganske divergerende, og de har et variabelt antall transmembrane helixer, men de kan klassifiseres i syv familier som henholdsvis har blitt betegnet: araH, cysTW, fecCD, hisMQ, livHM, malFG og oppBC.
Blight: Blight refererer til et bestemt symptom som påvirker planter som svar på infeksjon av en patogen organisme.
Bakteriell rødhet (bygg): Bakteriell blight er en sykdom av bygg forårsaket av bakteriepatogenet Xanthomonas campestris pv. translucens . Det har vært kjent som en sykdom siden slutten av 1800-tallet. Den har en verdensomspennende distribusjon.
Bakteriell svamp av kassava: Xanthomonas axonopodis pv. manihotis er patogenet som forårsaker bakteriell rødme av kassava . Opprinnelig oppdaget i Brasil i 1912, har sykdommen fulgt dyrking av kassava over hele verden. Blant sykdommer som rammer kassava over hele verden, forårsaker bakteriell røde de største tapene når det gjelder avling.
Bakteriell smuss av bomull: Bakteriell røde bomull er en sykdom som rammer bomullsplanten som følge av infeksjon av Xanthomonas axonopodis pathovar malvacearum (Xcm), en gramnegativ, motil stavformet, ikke spordannende bakterie med et enkelt polært flagellum
Bakteriell svamp av soyabønner: Bakteriell svamp av soyabønner er en utbredt sykdom forårsaket av Pseudomonas syringae pv. glycinea.
Bakterie: Bakterier er en type biologisk celle. De utgjør et stort domene av prokaryote mikroorganismer. Vanligvis noen få mikrometer i lengde, bakterier har en rekke former, alt fra kuler til stenger og spiraler. Bakterier var blant de første livsformene som dukket opp på jorden, og er til stede i de fleste av dens habitater. Bakterier lever i jord, vann, sure varme kilder, radioaktivt avfall og den dype biosfæren til jordskorpen. Bakterier lever også i symbiotiske og parasittiske forhold til planter og dyr. De fleste bakterier har ikke blitt karakterisert, og bare om lag 27 prosent av bakteriefylene har arter som kan dyrkes i laboratoriet. Studien av bakterier er kjent som bakteriologi, en gren av mikrobiologi.
Bakteriell myk råte: Bakterielle myke rotter er forårsaket av flere typer bakterier, men oftest av arter av gramnegative bakterier, Erwinia , Pectobacterium og Pseudomonas . Det er en destruktiv sykdom av frukt, grønnsaker og prydplanter som finnes over hele verden, og rammer slekter fra nesten alle plantefamiliene. Bakteriene angriper hovedsakelig de kjøttfulle lagringsorganene til vertene deres, men de påvirker også saftige knopper, stilker og petiolevev. Ved hjelp av spesielle enzymer blir planten omgjort til en flytende mos for at bakteriene skal konsumere plantecellens næringsstoffer. Sykdomsutbredelse kan være forårsaket av enkel fysisk interaksjon mellom infisert og sunt vev under lagring eller transitt. Sykdommen kan også spres av insekter. Kontroll av sykdommen er ikke alltid veldig effektiv, men hygienepraksis i produksjon, lagring og prosessering er noe som kan gjøres for å bremse spredningen av sykdommen og beskytte avlingene.
Canker: En plante kanker er et lite område med dødt vev, som vokser sakte, ofte over år. Noen cankers har bare mindre konsekvenser, men andre er til slutt dødelige og derfor av stor økonomisk betydning i jordbruk og hagebruk. Årsakene deres inkluderer et så bredt spekter av organismer som sopp, bakterier, mycoplasmas og virus. Flertallet av kreftfremkallende organismer er bundet til en unik vertsart eller slekt, men noen få vil angripe andre planter. Vær og dyr kan spre seg kreft, og dermed fare for områder som bare har liten kreft.
Bakteriekapsel: Bakteriekapslen er en stor struktur som er felles for mange bakterier. Det er et polysakkaridlag som ligger utenfor cellehylsteret, og anses derfor som en del av den ytre hylsteret til en bakteriecelle. Det er et godt organisert lag, ikke lett vasket av, og det kan være årsaken til forskjellige sykdommer.
Bakteriekapsel: Bakteriekapslen er en stor struktur som er felles for mange bakterier. Det er et polysakkaridlag som ligger utenfor cellehylsteret, og anses derfor som en del av den ytre hylsteret til en bakteriecelle. Det er et godt organisert lag, ikke lett vasket av, og det kan være årsaken til forskjellige sykdommer.
Bakteriell cellestruktur: Bakterien, til tross for sin enkelhet, inneholder en velutviklet cellestruktur som er ansvarlig for noen av dens unike biologiske strukturer og patogenisitet. Mange strukturelle trekk er unike for bakterier og finnes ikke blant arkeaer eller eukaryoter. På grunn av enkelheten til bakterier i forhold til større organismer og hvor enkelt de kan manipuleres eksperimentelt, har cellestrukturen til bakterier blitt studert godt, og avslører mange biokjemiske prinsipper som senere er blitt brukt på andre organismer.
Celleveggen: En cellevegg er et strukturelt lag som omgir noen typer celler, rett utenfor cellemembranen. Det kan være tøft, fleksibelt og noen ganger stivt. Det gir cellen både strukturell støtte og beskyttelse, og fungerer også som en filtreringsmekanisme. Cellevegger er tilstede i de fleste prokaryoter, i alger, sopp og eukaryoter inkludert planter, men er fraværende hos dyr. En viktig funksjon er å fungere som trykkbeholdere, og forhindre overutvidelse av cellen når vann kommer inn.
Bakterielle cellulære morfologier: Bakterier og Archaea klassifiseres ved direkte undersøkelse med lysmikroskopet i henhold til deres morfologi og arrangement.
Bakteriell cellulose: Bakteriell cellulose er en organisk forbindelse med formelen (C 6 H 10 O 5 ) n produsert av visse typer bakterier. Mens cellulose er et grunnleggende strukturmateriale for de fleste planter, produseres det også av bakterier, hovedsakelig av slektene Acetobacter , Sarcina ventriculi og Agrobacterium . Bakteriell, eller mikrobiell, cellulose har forskjellige egenskaper enn plantecellulose og er preget av høy renhet, styrke, formbarhet og økt evne til å holde vann. I naturlige habitater syntetiserer flertallet av bakterier ekstracellulære polysakkarider, som cellulose, som danner beskyttende konvolutter rundt cellene. Mens bakteriell cellulose produseres i naturen, blir mange metoder for tiden undersøkt for å forbedre cellulosevekst fra kulturer i laboratorier som en storskala prosess. Ved å kontrollere syntesemetoder kan den resulterende mikrobielle cellulosen skreddersys for å ha spesifikke ønskelige egenskaper. For eksempel har bakteriene Acetobacter xylinum blitt lagt merke til på grunn av cellulosens unike mekaniske egenskaper og anvendelser innen bioteknologi, mikrobiologi og materialvitenskap. Historisk har bakteriecellulose vært begrenset til fremstilling av Nata de coco, et sørøstasiatisk matprodukt. Med fremskritt i evnen til å syntetisere og karakterisere bakteriell cellulose, blir materialet brukt til et bredt spekter av kommersielle bruksområder, inkludert tekstiler, kosmetikk og matvarer, så vel som medisinske anvendelser. Mange patenter er utstedt i mikrobiell celluloseapplikasjon, og flere aktive forskningsområder forsøker å bedre karakterisere mikrobiell cellulose og bruke den i nye områder.
Kjemotaksi: Chemotaxis er bevegelsen til en organisme eller enhet som svar på en kjemisk stimulus. Somatiske celler, bakterier og andre encellede eller flercellede organismer styrer bevegelsene sine i henhold til visse kjemikalier i omgivelsene. Dette er viktig for bakterier å finne mat ved å svømme mot den høyeste konsentrasjonen av matmolekyler, eller å flykte fra gift. I flercellede organismer er cellegift avgjørende for tidlig utvikling og påfølgende utviklingsfaser, så vel som for normal funksjon og helse. I tillegg er det blitt anerkjent at mekanismer som tillater cellegift hos dyr kan undergraves under kreftmetastase. Den avvikende kjemotaksien til leukocytter og lymfocytter bidrar også til inflammatoriske sykdommer som aterosklerose, astma og leddgikt. Undercellulære komponenter, slik som polaritetsplasteret som genereres av parring av gjær, kan også vise kjemotaktisk oppførsel.
Kjemotaksi: Chemotaxis er bevegelsen til en organisme eller enhet som svar på en kjemisk stimulus. Somatiske celler, bakterier og andre encellede eller flercellede organismer styrer bevegelsene sine i henhold til visse kjemikalier i omgivelsene. Dette er viktig for bakterier å finne mat ved å svømme mot den høyeste konsentrasjonen av matmolekyler, eller å flykte fra gift. I flercellede organismer er cellegift avgjørende for tidlig utvikling og påfølgende utviklingsfaser, så vel som for normal funksjon og helse. I tillegg er det blitt anerkjent at mekanismer som tillater cellegift hos dyr kan undergraves under kreftmetastase. Den avvikende kjemotaksien til leukocytter og lymfocytter bidrar også til inflammatoriske sykdommer som aterosklerose, astma og leddgikt. Undercellulære komponenter, slik som polaritetsplasteret som genereres av parring av gjær, kan også vise kjemotaktisk oppførsel.
Kromatofor (bakterier): I noen former for fotosyntetiske bakterier er en kromatofor en farget, membranassosiert vesikkel som brukes til å utføre fotosyntese. De inneholder forskjellige fargede pigmenter.
Kromatofor (bakterier): I noen former for fotosyntetiske bakterier er en kromatofor en farget, membranassosiert vesikkel som brukes til å utføre fotosyntese. De inneholder forskjellige fargede pigmenter.
Kromosom: Et kromosom er et langt DNA-molekyl med deler av eller hele genetisk materiale i en organisme. De fleste eukaryote kromosomer inkluderer emballasjeproteiner kalt histoner som, hjulpet av kaperonproteiner, binder til og kondenserer DNA-molekylet for å opprettholde dets integritet. Disse kromosomene viser en kompleks tredimensjonal struktur, som spiller en viktig rolle i transkripsjonsregulering.
Bakteriell døgnrytme: Bakterielle døgnrytmer , som andre døgnrytmer, er endogene "biologiske klokker" som har følgende tre egenskaper: (a) under konstante forhold svinger de med en periode som er nær, men ikke nøyaktig, 24 timer i varighet, (b) denne "frittløpende" rytmen er temperaturkompensert, og (c) rytmen vil medføre en passende miljøsyklus.
Bakteriell døgnrytme: Bakterielle døgnrytmer , som andre døgnrytmer, er endogene "biologiske klokker" som har følgende tre egenskaper: (a) under konstante forhold svinger de med en periode som er nær, men ikke nøyaktig, 24 timer i varighet, (b) denne "frittløpende" rytmen er temperaturkompensert, og (c) rytmen vil medføre en passende miljøsyklus.
Slippfaktor: En frigjøringsfaktor er et protein som muliggjør avslutning av translasjon ved å gjenkjenne termineringskodonet eller stoppkodonet i en mRNA-sekvens. De blir kalt slik fordi de frigjør nye peptider fra ribosomet.
Bakterielt kunstig kromosom: Et bakterielt kunstig kromosom ( BAC ) er en DNA-konstruksjon, basert på et funksjonelt fruktbarhetsplasmid, brukt til transformasjon og kloning i bakterier, vanligvis E. coli . F-plasmider spiller en avgjørende rolle fordi de inneholder partisjonsgener som fremmer jevn fordeling av plasmider etter bakteriecelledeling. Det bakterielle kunstige kromosomets vanlige innsatsstørrelse er 150–350 kbp. En lignende kloningsvektor kalt PAC er også produsert fra DNA fra P1-bakteriofag.
Bakteriell kaldtvannsykdom: Bakteriell kaldtvannsykdom (BCWD) er en bakteriell sykdom hos ferskvannsfisk, spesielt laksefisk. Det er forårsaket av bakterien Flavobacterium psychrophilum , en psykrofil, gram-negativ stavformet bakterie av familien Flavobacteriaceae. Denne bakterien finnes i ferskvann med den optimale veksttemperaturen under 13⁰C, og den kan sees i ethvert område med vanntemperaturer konstant under 15⁰C. Laks er den mest berørte arten. Denne sykdommen er ikke zoonotisk.
Bakteriell kaldtvannsykdom: Bakteriell kaldtvannsykdom (BCWD) er en bakteriell sykdom hos ferskvannsfisk, spesielt laksefisk. Det er forårsaket av bakterien Flavobacterium psychrophilum , en psykrofil, gram-negativ stavformet bakterie av familien Flavobacteriaceae. Denne bakterien finnes i ferskvann med den optimale veksttemperaturen under 13⁰C, og den kan sees i ethvert område med vanntemperaturer konstant under 15⁰C. Laks er den mest berørte arten. Denne sykdommen er ikke zoonotisk.
Kolitt: Kolitt er en betennelse i tykktarmen. Kolitt kan være akutt og selvbegrenset eller langvarig. Det passer stort sett inn i kategorien fordøyelsessykdommer.
Koloni (biologi): I biologien består en koloni av to eller flere konspesifikke individer som lever i nær tilknytning til, eller er knyttet til hverandre. Denne foreningen er vanligvis til gjensidig nytte, for eksempel sterkere forsvar eller evnen til å angripe større byttedyr. Det er en klynge av identiske celler (kloner) på overflaten av et fast medium, vanligvis avledet fra en enslig foreldercelle, som i bakteriekoloni. I motsetning er ensomme organismer de der alle individer lever uavhengig og har alle funksjonene som trengs for å overleve og reprodusere.
Optimalisering av bakteriekoloni: Optimaliseringsalgoritmen for bakteriekolonien er en optimaliseringsalgoritme som er basert på en livssyklusmodell som simulerer noen typiske atferd av E. coli-bakterier i løpet av hele deres livssyklus, inkludert cellegift, kommunikasjon, eliminering, reproduksjon og migrasjon.
Mikrobielt konsortium: Et mikrobielt konsortium eller mikrobielt samfunn er to eller flere bakterie- eller mikrobielle grupper som lever symbiotisk. Konsortier kan være endosymbiotiske eller ektosymbiotiske, eller noen ganger kan begge være. Protisten Mixotricha paradoxa , i seg selv en endosymbiont av Mastotermes darwiniensis termite, er alltid funnet som et konsortium av minst en endosymbiotisk coccus, flere ektosymbiotiske arter av flagellat- eller ciliatbakterier, og minst en art av spiralformede Treponema- bakterier som danner grunnlaget for Mixotricha protists bevegelse.
Bakteriell konjugasjon: Bakteriell konjugasjon er overføring av genetisk materiale mellom bakterieceller ved direkte celle-til-celle-kontakt eller ved en brolignende forbindelse mellom to celler. Dette skjer gjennom en pilus. Det er en parasexual reproduksjonsmåte hos bakterier.
Konjunktivitt: Konjunktivitt , også kjent som rosa øye , er betennelse i det ytterste laget av den hvite delen av øyet og den indre overflaten av øyelokket. Det får øyet til å se rosa eller rødaktig ut. Smerter, svie, riper eller kløe kan forekomme. Det berørte øyet kan ha økt tårene eller være "stengt lukket" om morgenen. Hevelse i den hvite delen av øyet kan også forekomme. Kløe er mer vanlig i tilfeller på grunn av allergi. Konjunktivitt kan påvirke ett eller begge øynene.
Mikrobielt konsortium: Et mikrobielt konsortium eller mikrobielt samfunn er to eller flere bakterie- eller mikrobielle grupper som lever symbiotisk. Konsortier kan være endosymbiotiske eller ektosymbiotiske, eller noen ganger kan begge være. Protisten Mixotricha paradoxa , i seg selv en endosymbiont av Mastotermes darwiniensis termite, er alltid funnet som et konsortium av minst en endosymbiotisk coccus, flere ektosymbiotiske arter av flagellat- eller ciliatbakterier, og minst en art av spiralformede Treponema- bakterier som danner grunnlaget for Mixotricha protists bevegelse.
Mikrobiologisk kultur: En mikrobiologisk kultur , eller mikrobiell kultur , er en metode for å multiplisere mikrobielle organismer ved å la dem reprodusere i forhåndsbestemt dyrkningsmedium under kontrollerte laboratorieforhold. Mikrobielle kulturer er grunnleggende og grunnleggende diagnostiske metoder som brukes som forskningsverktøy i molekylærbiologi.
Urinveisinfeksjon: En urinveisinfeksjon ( UTI ) er en infeksjon som påvirker deler av urinveiene. Når det påvirker nedre urinveier, er det kjent som en blæreinfeksjon ( blærebetennelse ), og når det påvirker de øvre urinveiene, er det kjent som en nyreinfeksjon (pyelonefritt). Symptomer på nedre urinveisinfeksjon inkluderer smerter ved vannlating, hyppig vannlating og følelse av behov for å urinere til tross for at de har en tom blære. Symptomer på en nyreinfeksjon inkluderer feber og smerter i flanken vanligvis i tillegg til symptomene på en lavere UTI. Sjelden kan urinen virke blodig. Hos de veldig gamle og de aller minste kan symptomene være vage eller uspesifikke.
Prokaryot cytoskelett: Det prokaryote cytoskjelettet er samlenavnet for alle strukturelle filamenter i prokaryoter. En gang ble det antatt at prokaryote celler ikke hadde cytoskjeletter, men fremskritt innen visualiseringsteknologi og strukturbestemmelse førte til oppdagelsen av filamenter i disse cellene på begynnelsen av 1990-tallet. Ikke bare har analoger for alle større cytoskeletale proteiner i eukaryoter blitt funnet i prokaryoter, cytoskeletale proteiner uten kjente eukaryote homologer er også blitt oppdaget. Cytoskeletale elementer spiller viktige roller i celledeling, beskyttelse, formbestemmelse og polaritetsbestemmelse i forskjellige prokaryoter.
Pullulanase: Pullulanase er en bestemt type glukanase, et amylolytisk eksoenzym, som nedbryter pullulan. Den produseres som et ekstracellulært, celleoverflatefestet lipoprotein av gramnegative bakterier av slekten Klebsiella . Type I pullulanaser angriper spesifikt α-1,6 bindinger, mens type II pullulanaser også er i stand til å hydrolysere α-1,4 bindinger. Det er også produsert av noen andre bakterier og archaea. Pullulanase brukes som et prosesseringshjelpemiddel innen kornprosessering av bioteknologi.
Nedbrytning: Nedbrytning er prosessen der døde organiske stoffer brytes ned til enklere organisk eller uorganisk materiale som karbondioksid, vann, enkle sukkerarter og mineralsalter. Prosessen er en del av næringssyklusen og er viktig for resirkulering av det endelige stoffet som opptar fysisk plass i biosfæren. Kropper av levende organismer begynner å brytes ned kort tid etter døden. Dyr, som ormer, hjelper også til å spalte de organiske materialene. Organismer som gjør dette er kjent som nedbrytere. Selv om ingen organismer brytes ned på samme måte, gjennomgår de alle de samme sekvensielle stadier av nedbrytning. Vitenskapen som studerer nedbrytning blir generelt referert til som taphonomi fra det greske ordet taphos , som betyr grav. Nedbrytning kan også være en gradvis prosess for organismer som har lengre hvileperioder.
Avkolonisering (medisin): Avkolonisering , også bakteriell avkolonisering , er en medisinsk intervensjon som prøver å kvitte en pasient for et antimikrobielt resistent patogen, slik som meticillinresistent Staphylococcus aureus (MRSA) eller soppresistent Candida .
Avkolonisering (medisin): Avkolonisering , også bakteriell avkolonisering , er en medisinsk intervensjon som prøver å kvitte en pasient for et antimikrobielt resistent patogen, slik som meticillinresistent Staphylococcus aureus (MRSA) eller soppresistent Candida .
Patogene bakterier: Patogene bakterier er bakterier som kan forårsake sykdom. Denne artikkelen fokuserer på bakteriene som er patogene for mennesker. De fleste bakteriearter er ufarlige og er ofte gunstige, men andre kan forårsake smittsomme sykdommer. Antallet av disse patogene artene hos mennesker anslås å være færre enn hundre. Derimot er flere tusen arter en del av tarmfloraen i fordøyelseskanalen.
Patogene bakterier: Patogene bakterier er bakterier som kan forårsake sykdom. Denne artikkelen fokuserer på bakteriene som er patogene for mennesker. De fleste bakteriearter er ufarlige og er ofte gunstige, men andre kan forårsake smittsomme sykdommer. Antallet av disse patogene artene hos mennesker anslås å være færre enn hundre. Derimot er flere tusen arter en del av tarmfloraen i fordøyelseskanalen.
Bakteriell skjerm: Bakteriell skjerm er en proteinteknisk teknikk som brukes til in vitro proteinutvikling. Biblioteker av polypeptider som vises på overflaten av bakterier, kan screenes ved hjelp av strømningscytometri eller iterative utvalgsprosedyrer (biopanning). Denne proteinkonstruksjonsteknikken lar oss koble funksjonen til et protein med genet som koder det. Bakteriell visning kan brukes til å finne målproteiner med ønskede egenskaper og kan brukes til å lage affinitetsligander som er cellespesifikke. Dette systemet kan brukes i mange applikasjoner, inkludert opprettelse av nye vaksiner, identifisering av enzymsubstrater og å finne affiniteten til en ligand for dets målprotein.
Bakteriell phyla: Bakteriefyler utgjør de viktigste linjene til domenet Bakterier . Mens den nøyaktige definisjonen av en bakteriell fylum er diskutert, er en populær definisjon at en bakteriell fylum er en monofyletisk avstamning av bakterier hvis 16S rRNA-gener deler en parvis sekvensidentitet på ~ 75% eller mindre med medlemmene i annen bakteriell phyla.
Bakterielt effektorprotein: Bakterielle effektorer er proteiner som skilles ut av patogene bakterier i cellene til verten, vanligvis ved hjelp av et type 3-sekresjonssystem (TTSS / T3SS), et type 4-sekresjonssystem (TFSS / T4SS) eller et Type VI-sekresjonssystem (T6SS). Noen bakterier injiserer bare noen få effektorer i vertscellene, mens andre kan injisere dusinvis eller hundrevis. Effektorproteiner kan ha mange forskjellige aktiviteter, men hjelper vanligvis patogenet med å invadere vertsvevet, undertrykke immunforsvaret eller på annen måte hjelpe patogenet til å overleve. Effektorproteiner er vanligvis kritiske for virulens. For eksempel, i det forårsakende middel for pest, er tapet av T3SS tilstrekkelig til å gjøre bakteriene fullstendig avirulente, selv når de blir direkte introdusert i blodet. Gramnegative mikrober mistenkes også å distribuere bakterielle ytre membranvesikler for å translokere effektorproteiner og virulensfaktorer via en sekretærvei for handel med membranvesikler for å modifisere miljøet eller angripe / invadere målceller, for eksempel ved vertspatogengrensesnittet.
Bakterielt effektorprotein: Bakterielle effektorer er proteiner som skilles ut av patogene bakterier i cellene til verten, vanligvis ved hjelp av et type 3-sekresjonssystem (TTSS / T3SS), et type 4-sekresjonssystem (TFSS / T4SS) eller et Type VI-sekresjonssystem (T6SS). Noen bakterier injiserer bare noen få effektorer i vertscellene, mens andre kan injisere dusinvis eller hundrevis. Effektorproteiner kan ha mange forskjellige aktiviteter, men hjelper vanligvis patogenet med å invadere vertsvevet, undertrykke immunforsvaret eller på annen måte hjelpe patogenet til å overleve. Effektorproteiner er vanligvis kritiske for virulens. For eksempel, i det forårsakende middel for pest, er tapet av T3SS tilstrekkelig til å gjøre bakteriene fullstendig avirulente, selv når de blir direkte introdusert i blodet. Gramnegative mikrober mistenkes også å distribuere bakterielle ytre membranvesikler for å translokere effektorproteiner og virulensfaktorer via en sekretærvei for handel med membranvesikler for å modifisere miljøet eller angripe / invadere målceller, for eksempel ved vertspatogengrensesnittet.
Infektiøs endokarditt: Infektiøs endokarditt er en infeksjon i den indre overflaten av hjertet, vanligvis ventilene. Tegn og symptomer kan omfatte feber, små blødningsområder i huden, hjertemusling, tretthet og lavt antall røde blodlegemer. Komplikasjoner kan omfatte bakoverblodstrøm i hjertet, hjertesvikt - hjertet som sliter med å pumpe tilstrekkelig mengde blod for å dekke kroppens behov, unormal elektrisk ledning i hjertet, hjerneslag og nyresvikt.
Endokarditt: Endokarditt er en betennelse i det indre laget av hjertet, endokardiet. Det involverer vanligvis hjerteventilene. Andre strukturer som kan være involvert inkluderer interventrikulært septum, chordae tendineae, veggmaleriet endokardium eller overflatene til intrakardiale enheter. Endokarditt er preget av lesjoner, kjent som vegetasjoner , som er en masse blodplater, fibrin, mikrokolonier av mikroorganismer og små inflammatoriske celler. I den subakutte formen av infektiøs endokarditt kan vegetasjonen også omfatte et senter av granulomatøst vev, som kan fibrose eller forkalkes.
Endospore: En endospore er en sovende, tøff og ikke-reproduktiv struktur produsert av noen bakterier i phylum Firmicutes. Navnet "endospore" tyder på en spore eller frølignende form, men det er ikke en ekte spore. Det er en strippet, sovende form som bakterien kan redusere seg selv til. Endosporedannelse utløses vanligvis av mangel på næringsstoffer, og forekommer vanligvis i gram-positive bakterier. Ved endospordannelse deler bakterien seg innenfor celleveggen, og den ene siden omslutter den andre. Endosporer gjør det mulig for bakterier å ligge i dvale i lengre perioder, til og med århundrer. Det er mange rapporter om at sporene er levedyktige i 10 000 år, og det er blitt hevdet gjenopplivelse av millioner av år gamle sporer. Det er en rapport om levedyktige sporer av Bacillus marismortui i saltkrystaller som er omtrent 250 millioner år gamle. Når miljøet blir gunstigere, kan endosporen reaktivere seg selv til den vegetative tilstanden. De fleste typer bakterier kan ikke endres til endosporeformen. Eksempler på bakteriearter som kan danne endosporer inkluderer Bacillus cereus , Bacillus anthracis , Bacillus thuringiensis , Clostridium botulinum og Clostridium tetani .
Endospore: En endospore er en sovende, tøff og ikke-reproduktiv struktur produsert av noen bakterier i phylum Firmicutes. Navnet "endospore" tyder på en spore eller frølignende form, men det er ikke en ekte spore. Det er en strippet, sovende form som bakterien kan redusere seg selv til. Endosporedannelse utløses vanligvis av mangel på næringsstoffer, og forekommer vanligvis i gram-positive bakterier. Ved endospordannelse deler bakterien seg innenfor celleveggen, og den ene siden omslutter den andre. Endosporer gjør det mulig for bakterier å ligge i dvale i lengre perioder, til og med århundrer. Det er mange rapporter om at sporene er levedyktige i 10 000 år, og det er blitt hevdet gjenopplivelse av millioner av år gamle sporer. Det er en rapport om levedyktige sporer av Bacillus marismortui i saltkrystaller som er omtrent 250 millioner år gamle. Når miljøet blir gunstigere, kan endosporen reaktivere seg selv til den vegetative tilstanden. De fleste typer bakterier kan ikke endres til endosporeformen. Eksempler på bakteriearter som kan danne endosporer inkluderer Bacillus cereus , Bacillus anthracis , Bacillus thuringiensis , Clostridium botulinum og Clostridium tetani .
Cellekonvolutt: Cellehylsen består av den indre cellemembranen og celleveggen til en bakterie. I gramnegative bakterier er også en ytre membran inkludert. Denne konvolutten er ikke tilstede i Mollicutes der celleveggen er fraværende.